بصفة عامة فإن العلاج الذي يستخدم في أطفال الأنابيب لتنشيط التبويض ثبت أمانه تماماً و لم يثبت أنه يتسبب في أي خطر للإصابة بالسرطان أو استنفاد البويضات او اى مشاكل اخرى على المدى الطويل. و قد بسبب العلاج بعض الألم في البطن. فقط عند السيدات اللاتي يعانين من درجة كبيرة من تكيس المبايض قد يتسبب العلاج في التحفيز المفرط للمبايض حيث تستجيب المبايض للعلاج بصورة مفرطة أكثر مما هو مطلوب مما يتسبب في تضخم المبايض و بالتالي انتفاخ و ألم في البطن. و قد نجحنا في المركز العربى للخصوبة في تقليل نسبة حدوث هذه الحالات لأقل من 1% من الحالات بفضل الاحتياطات الدقيقة المتبعة في المركز. وفى معظم هذة الحالات يتم تحذير المريضة قبل سحب البويضات.